FastQCFastQC Report
Thu 13 Dec 2018
Test01_L001_R1_001.fastq

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameTest01_L001_R1_001.fastq
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences800
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length179-251
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC22127.625No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC14217.75No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC11514.374999999999998No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC9211.5No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGT141.7500000000000002No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGT131.625No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAACTTGTTGC111.375No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGT111.375No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGCTGTTGC101.25No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGT81.0No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAGTTGTTGC70.8750000000000001No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTGAAGTTGCTGC60.75No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAGTTGTTGC60.75No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAACTTGTTGC50.625No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAATTGTTGC50.625No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGCTGTTGC50.625No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAGTTGTTGC40.5No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGCTGTTGC40.5No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGCTGTTGC40.5No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAATTGTTGC40.5No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTGAAGTTGCTGC40.5No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATGTTAAAGTTGTTGC40.5No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAACTTGTTGC40.5No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAGTTGTTGC40.5No Hit
CCAGCAGCCGCGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCG30.375No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATGTTAAAGTTGTTGC30.375No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATGGCGTATATTAAAGTTGTTGC30.375No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAATTGTTGC30.375No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAAGAGCGTATATTAAAGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTACATTAAAGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAATGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAAAAGTGTATATTTAAGTTGCTGC20.25No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAAAGTGTATATTTAAGTTGCTGC20.25No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGTTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAATTGTTGC20.25No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAAAGTGTATATTTAAGTTGCTGC20.25No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGTGTATATTTAAGTTGCTGC20.25No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAACTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCACCCGCGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCG20.25No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATACTAATGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGTGTATATTAAAGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATCTTAATGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTCAAGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGAATCTTAATGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTACATCACACATGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAATTTGTTGC10.125No Hit
CCCGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCCCCAGGGACGCATACTAAAATCGTGAC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTTGTCAAAGCTCGTACT10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGGAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAATTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGTGTATATTTAAGTTGCTGC10.125No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTGAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTTCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGCTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCGATAGCGTATATTGAAGTTCTTGC10.125No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTGGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAGTAGCGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTGAAGTTGCTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAACGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGTTCAAATAACGTATACTTATGTGCTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGTCATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCG10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAACTTGCTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCCTCTACAGCGGAATGCAAAAGTTGCGC10.125No Hit
CCCGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTGTATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCATCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATACTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATACTAAAATTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGTCATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGGTGTTGCG10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAGGAGTGTATATTAAAGCTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAGTAGCGTATATTAAATCTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAACGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATCAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATACTAATGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCCCCAACCGCGTGCATTAAAGTGGTAGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATCTATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCACCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAGTAGCGTATATTAAATCTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCG10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAATTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATCTTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTTGACAAAGCTCGTACT10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTGAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTACATCAAACATGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAATGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTACGTTAATGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTGAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAACGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTACTTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTTGTCAAAGCTCGTACT10.125No Hit
CCAGCCGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTATAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCGG10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTTAGTTGTTGC10.125No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph