FastQCFastQC Report
Thu 13 Dec 2018
Test02_L001_R1_001.fastq

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameTest02_L001_R1_001.fastq
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences800
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length57-251
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC20325.374999999999996No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC16020.0No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC11414.249999999999998No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC698.625No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCCTCCACAAGCATATGCAAAAGTTGCTG222.75No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGCTGTTGC121.5No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGCTGTTGC121.5No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCCTCCACAAGCATATGCAAAAGTTGCTG101.25No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAATTGTTGC91.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCCTCCACAAGCATATGCAAAAGTTGCTG81.0No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGCTGTTGC70.8750000000000001No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGCTGTTGC60.75No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATACTAAAGTTGTTGC60.75No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAACTTGTTGC60.75No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGT60.75No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCCTCCACAAGCATATGCAAAAGTTGCTG50.625No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAATTGTTGC50.625No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGT50.625No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAATTGTTGC50.625No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAATTGTTGC40.5No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAGTTGTTGC40.5No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTTCAATAGCGTATACTTAAGTTGTTGT40.5No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAATGTTGTTGC40.5No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGC40.5No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAACTTGTTGC40.5No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAATTGTTGC40.5No Hit
CCAGACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCG30.375No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGT30.375No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGTGTATATTAAAGTTGTTGC30.375No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAAGTTGTTG30.375No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAATTGTTGC30.375No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTGAAGTTGTTGC30.375No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAGTTGTTGC30.375No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCGATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC30.375No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAATTTGTTGC30.375No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAATGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAATTGTTGC20.25No Hit
CCAGCACCTGGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCG20.25No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAACGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGTTCCAATCGCGCCTGTTAACGTTGTCGC20.25No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAACATTGTATATTAAAGTTGCTGT20.25No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATCGCGTATCCTAAATTTGTTGT20.25No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGTTCCAATAGCGTATATTAAAGATGTTGC20.25No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATGTTAAAGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCAGCTGCGGTATTCCAGCCTCCACAAGCATATGCAAAAGTTGCTGT20.25No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATATTAATGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAAGAGCGTATATTAAAGTTGTTGC20.25No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTACATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGT10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTGCAATTGCGTATGTTGAAGTTGCTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCCCCAATGATGTTTTCATCGATCAAGAACGAAAGT10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCCTCCACAAGCATTTTCAAAAGTTGCTG10.125No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAATGTTGTTGT10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCTAATAGCGTATATTAATGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATACTAATGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATTTTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTAGATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATAGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATACTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAATTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTACAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCCTCCACAAGCATATTCAAAATTTTCTG10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAGAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAGTCGCTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGTGTATATTAAAGTCGCTGT10.125No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTTCAATAGCGTATACTTAAGTTGTTGT10.125No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTTCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGT10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGGTGTTGCG10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGTGTATATTAAAGTTGCTGT10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTGAAGTTGCTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCA10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAGGTTGCGGT10.125No Hit
CCAGCACCCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTG10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCCTCCACAAGGATAAGCAAAGTTGTCTG10.125No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGTGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTGAAGTTGCTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGCGTATATTAAAATTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGTTCCAATAGCGTATATTAAATTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCCTCCACAAGCATCTGCAAAAGTTTCTG10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCCTCCACAAGCATATGCAAAAGTTTCTG10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTG10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAACTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCCTCCACAAGCATAATCAAAGGTTTCTG10.125No Hit
CTAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAATTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAATGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCCTCCACAAGCATATTCAAAAGTTGCTG10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAACCCCAGCACCAATAGTGTATACTAAAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCGG10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCCTCAACAAGCATATGCAAAAGTTGCTG10.125No Hit
CCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTACAGTTGTTGC10.125No Hit
CCAGCAGCTGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTATAGCTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCTAGCTCCAATAGCGTATATTAAAATTGTTGC10.125No Hit
CCAGCACCTGCGGTAATTCCAGCTCCGATAGCGTATATTAAAGTTGTTGC10.125No Hit

[OK]Adapter Content

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